Số động cơ trên Yamaha FJR 1300 có thể được tìm thấy ở phía bên trái của động cơ, ngay dưới đầu xi-lanh. Nó được đóng dấu vào kim loại của khối động cơ và thường có thể nhìn thấy được mà không cần tháo bất kỳ bộ phận nào. Số động cơ là mã định danh duy nhất được gán cho mỗi động cơ khi nó được sản xuất.
